Awards

The entries below use the same source as the Japanese page. Titles of Japanese-language works and linked articles retain their original language.

• 10th Bioindustry Encouragement Award (2026)

  • Recognized work: Computational molecular design technologies to support drug discovery across modalities
  • Awarding organization: Japan Bioindustry Association
  • https://www.jba.or.jp/entry/2026/07/002906/

• Special Award for Science Tokyo Advanced Researchers (STAR)(2025)

  • Recognized work: Pioneering drug discovery informatics across modalities
  • Awarding organization: Institute of Science Tokyo
  • https://www.isct.ac.jp/ja/news/r5w83ng3ivl3

• IPSJ Microsoft Research Award on Informatics (2024)

  • Recognized work: Computational design technologies for biomolecules
  • Awarding organization: Information Processing Society of Japan
  • https://www.ipsj.or.jp/award/microsoft-award.html

• CBI Society Young Investigator Award (2023)

  • Awarding organization: Chem-Bio Informatics Society
  • https://cbi-society.org/

• 35th Hiroshi Ando Memorial Academic Encouragement Award（2022）

  • Recognized work: 「Pioneering prediction technologies for bionanomaterials targeting proteins in living organisms」
  • Awarding organization: Ando Laboratory
  • http://www.ando-lab.or.jp/hyo-syo-.html
  • 大上雅史助教が第35回安藤博記念学術奨励賞を受賞 | 東工大ニュース | 東京工業大学 https://www.titech.ac.jp/news/2022/064403

• IPSJ Yamashita SIG Research Award（2022）

  • Recognized work: 「Prediction of blood-placental barrier permeability of compounds using GBDT」 (2021-BIO-65)
  • Awarding organization: Information Processing Society of Japan
  • http://www.ipsj.or.jp/award/yamashita2021.html

• Oxford Journals - JSBi Prize （2020）

  • Recognized work: 「Comprehensive prediction of protein-protein interactions」
  • Japanese Society for Bioinformatics - JSBi :: 2020年度 日本バイオインフォマティクス学会賞、および、Oxford Journals-JSBi Prize (OJP) 受賞者のお知らせ | https://www.jsbi.org/news/topics/20200903-jsbi-ojp/
  • Japanese Society for Bioinformatics - JSBi :: Oxford Journals - JSBi Bioinformatics Prize Winners | https://www.jsbi.org/about/oxford-journals-jsbi-bioinformatics-prize/
  • 大上助教がOxford Journals – JSBi Prizeを受賞しました | Ohue Laboratory | https://www.li.c.titech.ac.jp/20200903-386

• Young Scientists’ Award, Commendation for Science and Technology by the Minister of Education, Culture, Sports, Science and Technology（2019）

  • Recognized work: 「Comprehensive prediction of interactions involving proteins and other biological molecules」
  • 文部科学省 平成31年度科学技術分野の文部科学大臣表彰受賞者等の決定について | http://www.mext.go.jp/b_menu/houdou/31/04/1415044.htm
  • 平成３１年度科学技術分野の文部科学大臣表彰　表彰式 | http://www.mext.go.jp/b_menu/activity/detail/2019/20190417_3.htm

• 東工大関係者6名が平成31年度科学技術分野の文部科学大臣表彰を受賞 | 東工大ニュース | 東京工業大学 | https://www.titech.ac.jp/news/2019/044131.html

• 大上雅史助教が平成31年度科学技術分野の文部科学大臣表彰 若手科学者賞を受賞 | 情報工学系 News | 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系 | https://educ.titech.ac.jp/cs/news/2019_04/057355.html

• 秋山研究室News | http://www.bi.cs.titech.ac.jp/web/news2019_ja.html#2019-4-9

• 中分子IT創薬研究推進体 - 大上雅史助教が平成31年度科学技術分野の文部科学大臣表彰 若手科学者賞を受賞しました。 | http://www.midl.titech.ac.jp/ja/news/76

• Japanese Society for Bioinformatics - JSBi | 岩崎渉会員・大上雅史会員が平成31年度科学技術分野の文部科学大臣表彰 若手科学者賞を受賞 | https://www.jsbi.org/news/papers_awards/20190422/

• Early Career Award in Biophysics, Biophysical Society of Japan (2018)

  • 歴代若手招待講演賞受賞者 | 一般社団法人 日本生物物理学会

• Tokyo Tech Challenging Research Award (2018)

  • 平成30年度「Tokyo Tech Challenging Research Award」授賞式を実施−独創性豊かな若手研究者に− | 東工大ニュース
  • 平成30年度 挑戦的研究賞 受賞者のご紹介 | 東京工業大学 研究・産学連携本部
  • 細胞内PPI阻害を可能にするin silico中分子設計技術の開発 | 東京工業大学 研究・産学連携本部

• 公益財団法人 船井情報科学振興財団 Funai Research Encouragement Award (2018)

  • 大上雅史助教がFunai Research Encouragement Awardを受賞 | 情報工学系 News | 東京工業大学 情報理工学院 情報工学系
  • 秋山研究室News

• CBI Society Annual Meeting 2017 Poster Award (2017)

  • Kazuki Yamamoto, Ryuichi Kubo, Hiroyuki Yamasaki, Masahito Ohue, Yusuke Yamada: “ChemiSpadon: an SNS-based platform for human-assisted chemical space exploration”, CBI学会2017年大会, P5-08, 10/3-5, 2017. (poster)

• IIBMP2017 Excellent Poster Presentation Award (2017)

  • Naoki Wakui, Ryunosuke Yoshino, Nobuaki Yasuo, Masahito Ohue, Masakazu Sekijima: “Exploring the selectivity of inhibitor complexes with Bcl-2 and Bcl-XL: a molecular dynamics simulation approach”, Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2017 (IIBMP2017), P60, 2017. (poster)

• CBI Society Annual Meeting 2016 Poster Award (2016)

  • Kazuki Yamamoto, Yoshitaka Moriwaki, Keita Oda, Masahito Ohue, Itsuo Nakane, Ryunosuke Yoshino, Hayase Hakariya, Tadaaki Mashimo, Mitsuhito Wada, Yoshifumi Fukunishi: “Human insight in drug discovery: docking pose selection in protein-ligand docking and hit-compounds selection in structure-based virtual screening”, CBI学会2016年大会, P2-14, 10/26-28 2016. (poster)

• IIBMP2016 Poster Awards (2016) (two awards)

  • Masahito Ohue, Yuki YAmamoto, Hiroyuki Sato, Takashi Matsushita, Yutaka Akiyama: “MEGADOCK-Azure: High-performance protein-protein interaction prediction system on Microsoft Azure HPC”, Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2016 (IIBMP2016), P52, 2016. (poster)
  • Marina Yamasawa, Tomoya Fujii, Kota Goto, Masahito Ohue, Takashi Ishida, Kazuyuki Ishihara, Yutaka Akiyama: “GPU/MPI Parallelization of Metagenomic Sequence Homology Search Tool and Its Application to Oral Metagenomics”, Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2016 (IIBMP2016), P25, 2016. (poster) [Poster Award]

• Seiichi Tejima Research Award (Doctoral Dissertation Award) (2015)

  • 東京工業大学NEWS

• AHeDD'2014 (The Asia hub for e-drug discovery symposium 2014) Best Poster Award (2014)

  • Masahito Ohue, Takehiro Shimoda, Shuji Suzuki, Yuri Matsuzaki, Takashi Ishida, Yutaka Akiyama: “The MEGADOCK Project: high-performance protein-protein interaction prediction tools on supercomputing environments”, The Asia hub for e-drug discovery symposium 2014 (AHeDD’ 2014), P1, Nov. 2014.

• JSPS Ikushi Prize (2014)

  • List of recipients http://www.jsps.go.jp/j-ikushi-prize/ichiran_2_h25.html
  • About the Ikushi Prize http://www.jsps.go.jp/j-ikushi-prize/kettei_2_h25.html

• Student Encouragement Award, 73rd IPSJ National Convention（2011）

  • 大上雅史, 松崎由理, 秋山泰:“立体構造情報を用いたドッキング計算による大規模タンパク質-RNA間相互作用予測手法”，第73回情報処理学会全国大会，1ZF-8，Mar 2011．

• Presentation Award, IPSJ SIGMPS（2010）

  • 大上雅史, 松崎由理, 松��裕介, 佐藤智之, 秋山 泰:“MEGADOCK：立体構造情報からの網羅的タンパク質間相互作用予測とそのシステム生物学への応用”, 情報処理学会研究報告, 2010-MPS-78(3): 1-9, May 2010.

• DEIM2010 Student Encouragement Award（2010）

  • 大上雅史, 松��裕介, 松崎由理, 佐藤智之, 秋山泰: “エネルギー計算に基づくリランキングとクラスタリングを用いた網羅的タンパク質間相互作用予測手法の提案”, 第2回データ工学と情報マネジメントに関するフォーラム(DEIM2010), E4-4, Mar 2010.

• 2009 SIGBIO Student Encouragement Award（2010）

  • 大上雅史, 松��裕介, 松崎由理, 秋山泰: “網羅的タンパク質間相互作用予測システムにおける判別精度の改良”, 情報処理学会研究報告, 2009-BIO-18(3): 1-8, Sep 2009.

• Academic Excellence Award, Department of Electronics and Information Engineering, Ishikawa National College of Technology (top graduate)（2007）

• IEICE Hokuriku Section Excellent Student Paper Presentation Award（2006）

  • 大上雅史, 越野亮:“決定木による白血病遺伝子の自動分類ルールの抽出”，平成18年度電気関係学会北陸支部連合大会，F-57，Sep 2006．